genes listlengths 10 81 | label stringlengths 10 65 ⌀ |
|---|---|
[
"MT-ND6",
"MT-CO2",
"MT-CYB",
"MT-ND2",
"MT-ND5",
"MT-CO1",
"MT-ND3",
"MT-ND4",
"MT-ND1",
"MT-ATP6",
"MT-CO3",
"MT-ND4L",
"MT-ATP8",
"MTRNR2L8",
"MTRNR2L12"
] | mitochondrial respiratory chain |
[
"LETMD1",
"CIRBP",
"CCNB1IP1",
"TAF1D",
"ZFAS1",
"SELENOW",
"SNHG12",
"SNHG32",
"EPB41L4A-AS1",
"GAS5",
"SNHG6",
"SNHG8"
] | targets of nonsense-mediated decay |
[
"HSPA5",
"HERPUD1",
"TRAM1",
"NUCB2",
"MYDGF",
"DNAJB11",
"DNAJC3",
"KDELR1",
"SEC61B",
"SSR3",
"RPN2",
"SERP1",
"SSR1",
"CANX",
"SDF2L1",
"TMED7",
"KDELR2",
"PDIA6",
"MANF",
"HYOU1",
"PDIA4",
"SSR2",
"HSP90B1",
"PPIB",
"PDIA3",
"CALR",
"P4HB",
"SND1",
"OSTC",... | unfolded protein response |
[
"HIST1H2BJ",
"HIST1H4H",
"HIST1H2AC",
"HIST1H2BC",
"HIST3H2A",
"HIST1H1C",
"HIST1H2AG",
"HIST1H2BN",
"LINC00958",
"HIST1H2BH",
"HELLPAR"
] | histone genes |
[
"CYP51A1",
"MSMO1",
"IDI1",
"TFRC",
"FDFT1",
"SCD",
"SLC25A1",
"SQLE",
"SLC9A3R1",
"TMEM97",
"HMGCS1",
"HMGCR",
"DHCR24",
"ACAT2",
"ACLY",
"SLC40A1",
"MMAB",
"ABHD2",
"FADS1",
"TM7SF2",
"FDPS",
"CITED2",
"MVD",
"FASN",
"ELOVL6",
"DHCR7",
"INSIG1"
] | cholesterol homeostasis |
[
"ACSM3",
"PNN",
"CLN5",
"NPRL3",
"YWHAH",
"CYB561A3",
"MTHFD2L",
"FMC1",
"PCF11",
"ATF7IP2",
"SMIM4",
"MAT2A",
"SCAND1",
"CSTF3",
"EPM2AIP1",
"DPM3",
"ZNF708",
"H1FX",
"SLC39A10",
"PBX2",
"PPP1R10",
"THUMPD3-AS1",
"ERV3-1",
"MIR17HG",
"DANCR",
"HCG18",
"DLEU2",
... | dysregulated lncRNA antisense transcripts |
[
"RPL18",
"RPL31",
"RPL34",
"RPL22",
"RPL5",
"RPS15A",
"RPS24",
"RPL32",
"RPS3A",
"RPL37",
"RPL7",
"RPL26",
"RPS14",
"RPL13",
"RPL15",
"RPL37A"
] | translation |
[
"SLC25A5",
"EIF4B",
"SLC25A3",
"RPL3",
"CCNG1",
"RPL23",
"EIF2S3",
"HNRNPA1",
"RPS2",
"RPL7A",
"RPS3",
"SNHG16",
"EEF2",
"RPSA",
"RPS9",
"TOMM20",
"EIF3F",
"RPL14",
"RPL12",
"RPL10A",
"SNHG5",
"RPL41"
] | translation |
[
"RPS20",
"RPS5",
"RPS16",
"RPS19",
"RPL18A",
"RPL28",
"RPL19",
"COX7C",
"SEC11A",
"RPS11",
"RPL13A",
"HIGD2A",
"RPL10",
"RPL27A",
"RPS27",
"ACTG1",
"POLR1D",
"RPS23",
"RPL23A"
] | translation |
[
"LUC7L",
"DIS3",
"ACIN1",
"SF3B1",
"CEBPZ",
"SNRPA1",
"DEF8",
"HDGF",
"DDX46",
"PRPF39",
"MAGEA6",
"MAGEA12",
"MAGEA3"
] | null |
[
"AP2S1",
"THRAP3",
"SNRNP70",
"OAZ1",
"DDX5",
"CD81",
"SKP1",
"NUP214",
"H3F3B",
"EIF4E2",
"DEGS1",
"PTMS",
"H3F3A",
"CFL1",
"POLR2A",
"BCAP31",
"UBL5",
"BAG6"
] | null |
[
"RALA",
"STARD3NL",
"AKAP8L",
"ATP2B1",
"MED15",
"MTPN",
"SELENOK",
"DGUOK",
"SRSF11",
"ATP6V0B",
"RBM39",
"SRP14",
"BRD4",
"TMCO1",
"ARF1",
"LIMS1",
"GATA2",
"UBALD2",
"ATP6V0C",
"PTPN1",
"MAFG",
"PLCG2",
"YTHDF2"
] | null |
[
"SARS",
"ZCCHC8",
"GCAT",
"XBP1",
"TRIB3",
"MDK",
"RTN4",
"IGFBP2",
"CCND2",
"ATF4",
"SESN2",
"MAP1B",
"SLC31A1",
"IDH1",
"WARS",
"HAX1",
"DDIT4",
"RNF41",
"PRSS57",
"COLGALT2",
"CCPG1",
"LINC00662"
] | unfolded protein response mTORC1 signaling |
[
"BCAT1",
"MTHFD2",
"RAB27A",
"ERP29",
"AARS",
"PHGDH",
"PCK2",
"SLC7A5",
"SLC1A5",
"GARS",
"ALDH2",
"MTHFD1L",
"YARS",
"PSAT1",
"EPRS",
"PSPH",
"SLC7A11",
"SHMT2",
"EIF4EBP1",
"IARS",
"LONP1",
"CRNDE"
] | unfolded protein response mTORC1 signaling |
[
"ATP1B3",
"HADHA",
"MGST2",
"SEC22C",
"HCFC1R1",
"ELOB",
"FAM32A",
"HSPB1",
"ZNHIT1",
"COX6A1",
"CUTA",
"COX7A2",
"HMGN3",
"NDUFB3",
"ATP5F1E",
"ROMO1",
"COX6B1",
"UQCR11",
"PNKD",
"NEDD8",
"DAD1",
"COX7B",
"NDUFA2",
"SEC61G",
"DCTN3",
"COX17",
"ANAPC11",
"NDUFB... | oxidative phosphorylation |
[
"CHI3L2",
"OAT",
"BLVRB",
"KLF1",
"SLC2A1",
"NENF",
"NFE2",
"UROD",
"ASH2L",
"APOC1",
"HBZ",
"TMOD1",
"HEMGN",
"SLC39A8",
"SORD",
"MFGE8",
"SLC25A37",
"FEZ1",
"ERMAP",
"GFI1B",
"STAT3",
"FAM178B",
"TANGO2",
"C2orf88",
"HBG2",
"ANXA6",
"MYL4",
"MPIG6B",
"HBA1",... | erythroid differentiation |
[
"LTBP1",
"TSC22D1",
"TSPAN13",
"BLVRA",
"CCND3",
"FAM210B",
"NARF",
"MGST3",
"FAM83A",
"CARHSP1",
"ALAS2",
"GYPA",
"GYPE",
"GYPB"
] | erythroid differentiation |
[
"ERP44",
"DERA",
"FNIP2",
"FSCN1",
"KIFAP3",
"PCM1",
"STX7",
"NCOA1",
"GNAS",
"AAMDC",
"OSBPL8",
"MYL6",
"SNAP29",
"QPRT",
"FCGRT",
"ETFB",
"CPED1",
"VAT1",
"BIRC2",
"CORO1C",
"CERT1",
"TFDP2",
"ATP6V1A",
"HSDL2",
"CYSTM1",
"TAF12",
"POLR3GL",
"TRIM24",
"ATP6V... | null |
[
"PSMB1",
"PSMC4",
"RPL26L1",
"NDUFB4",
"UFD1",
"HSPB11",
"BZW1",
"PSMC5",
"CDC5L",
"ERH",
"PSMC1",
"PSMA6",
"PSMA7",
"IDH3B",
"PSMD7",
"RPA3",
"PSMA2",
"COA1",
"PSMD3",
"PSMD11",
"GNPDA1",
"PSMD14",
"NDUFA8",
"SNRPC",
"GLO1",
"PSMB2",
"PSMA1",
"ADRM1",
"POMP",... | proteasome genes |
[
"CFLAR",
"VIM",
"CAPG",
"FTL",
"NFKBIA",
"SOD2",
"AHNAK",
"SAT1",
"JUND",
"TUBB2B",
"IER3",
"UBC",
"RAB11FIP1",
"IFNGR2",
"IER2",
"SQSTM1",
"TUBA1A",
"JUNB",
"NABP1",
"ANXA2",
"ZFP36L1",
"ISG15",
"S100A10",
"TAPBP"
] | NFkB signaling |
[
"HIPK2",
"NCKAP1L",
"TPST2",
"ITM2B",
"TLN1",
"ACTR2",
"BCL2L11",
"FCER1G",
"LMNA",
"LRP10"
] | null |
[
"WAS",
"PIK3CB",
"CYBA",
"SPI1",
"BAX",
"LGALS1",
"PYCARD",
"TNNT1",
"PLIN3",
"CD33",
"AIP",
"ARPC3",
"GNAI2",
"VAMP8",
"ELF1",
"VASP",
"RAC2",
"ARHGEF6",
"ARPC1B",
"GMFG",
"CAP1",
"DOCK2",
"PAPSS1",
"SLC27A2",
"EMP3",
"SH3BGRL3",
"EVA1B",
"CD53",
"PTPN7",
"... | myeloid differentiation |
[
"MRPS24",
"IARS2",
"MRPS34",
"VDAC3",
"SLC27A5",
"TIMM13",
"POLD2",
"MRPS15",
"CHCHD5",
"NDUFA5",
"MRPL34",
"TXNL4A",
"ATP5MC1",
"BOLA3",
"CENPX",
"MRPL11",
"AURKAIP1"
] | null |
[
"TPR",
"CLSPN",
"CDC45",
"MSH2",
"MYBL2",
"PIH1D1",
"MCM3",
"GMNN",
"DROSHA",
"TTF2",
"HELLS",
"ZWINT",
"DGCR8",
"DUT",
"DNMT1",
"GINS2",
"FIGNL1",
"NASP",
"RFC3",
"ODF2",
"BRCA2",
"FANCI",
"PAXBP1",
"RBBP4",
"SLBP",
"MCM7",
"CDCA4",
"EXO1",
"TYMS",
"HIST2H2... | cell cycle |
[
"NDUFAB1",
"NDUFB2",
"PSMB5",
"PRPF31",
"CHCHD2",
"SUB1",
"POLE4",
"PARK7",
"ENY2",
"ECSIT",
"SNRPG",
"ATP5MC3",
"ATP5PF",
"PHB",
"NDUFS5",
"HINT1",
"TOMM5",
"SNRPE",
"XRCC6",
"TOMM7",
"RPS26",
"TOMM6",
"GTF2H5"
] | mitochondrial protein translocation and oxidative phopshorylation |
[
"ATP6AP1",
"ITM2A",
"NPC2",
"CREG1",
"UQCRB",
"B2M",
"GLB1",
"BSG",
"PSAP",
"HEXA"
] | null |
[
"KMT2E",
"JARID2",
"BOD1L1",
"KMT2C",
"IP6K2",
"AFF4",
"TNRC6B",
"ARHGAP5",
"MIB1",
"XIAP",
"ARMCX3",
"NFAT5",
"TUSC3",
"AK1",
"CLCN3",
"CPEB4",
"SPTBN1",
"TMEM59",
"ASH1L",
"PFDN5",
"NCOA3",
"PNISR",
"WBP2",
"CD63",
"CEP350",
"GOLGA4",
"RNF145",
"ADD3",
"ATM"... | null |
[
"MPHOSPH9",
"ASPM",
"TPX2",
"UBE2S",
"CENPA",
"CDC20",
"STMN1",
"CENPF",
"TUBA1B",
"CKS2",
"TOP2A",
"NUSAP1",
"MKI67",
"GSTO1",
"CCNB2",
"DBF4B",
"HMGB2",
"PTTG1",
"PCLAF",
"TUBA1C",
"NETO2",
"RRM2",
"TUBB4B",
"H2AFX",
"TUBB"
] | cell cycle |
[
"KDM1A",
"POLR2J",
"UQCRC1",
"PHPT1",
"PSMD8",
"NDUFB7",
"RBX1",
"FKBP3",
"PSMC6",
"CCDC34",
"NDUFS8",
"CDK2AP1",
"SRSF9",
"SPCS1",
"NDUFS7",
"TIMM17B",
"PIN1",
"EMC6",
"ATP5IF1",
"MRPS36",
"MRPL47",
"UQCC2",
"PNMT",
"ENSA",
"SRP9",
"ATG3",
"NDUFB9",
"PDXK",
"... | null |
[
"MAD1L1",
"PNPLA4",
"ERCC1",
"MRPS10",
"TNPO3",
"FAM50A",
"LYRM2",
"DYNLL1",
"PPP2R3C",
"SCFD1",
"EZR",
"MRPS18A",
"SNW1",
"DHRS7",
"COG4",
"C11orf58",
"CHKA",
"COQ5",
"VPS29",
"COPZ1",
"MRPS30",
"SNX4",
"AUP1",
"TSNAX",
"SDHB",
"NSL1",
"WASHC3",
"COPS5",
"RNF... | null |
[
"NUB1",
"ALAS1",
"SEC63",
"WNK1",
"VPS35",
"WAC",
"RAB18",
"MAPK1",
"STAG2",
"TJP1",
"TLE5",
"OCIAD1",
"UBE2D3",
"SNX3",
"CLINT1",
"MSH3",
"RNF7",
"TFG",
"BBX",
"ACTR3",
"SRSF4",
"RO60",
"PAIP2",
"PDLIM2",
"DESI2",
"LRIF1",
"RPAP2",
"SEPTIN7",
"KTN1",
"RAP1B... | growth signaling |
[
"CLNS1A",
"SNX5",
"PABPC4",
"HSP90AB1",
"RBM3",
"HSPA8",
"MS4A4A",
"ANP32B",
"MYC",
"EIF4A1",
"MRPL16",
"SNUPN",
"NPM1",
"PTMA",
"PHB2"
] | growth targets of Myc |
[
"THUMPD1",
"RIF1",
"SEPHS1",
"HNRNPC",
"HNRNPM",
"HNRNPA2B1",
"SYNCRIP",
"HNRNPD",
"HNRNPU",
"EIF5B",
"NOLC1",
"HNRNPA3"
] | hnRNP genes |
[
"YBX3",
"RANBP1",
"POP1",
"C1QBP",
"NCL",
"HSPE1",
"RAN",
"EIF5A",
"BZW2",
"GCSH",
"HSPD1",
"HNRNPDL",
"SRSF2",
"SNRPD1",
"PPIH",
"EIF1AX",
"ALYREF",
"HNRNPAB",
"JPT2",
"MIF"
] | growth targets of Myc |
[
"AK2",
"SS18L2",
"NOP16",
"HEBP2",
"MRTO4",
"YBX1",
"EIF2B3",
"TRIB2",
"DAZAP1",
"NUDC",
"FH",
"CDV3",
"NOP56",
"NAA10",
"GSPT1",
"NAMPT",
"EIF3B",
"RBM28",
"BLMH",
"CCDC47",
"DRG2",
"GPN3",
"NUP107",
"TPD52L1",
"HSPA9",
"MRPL3",
"RRP9",
"SRM",
"EBNA1BP2",
"... | ribosome biogenesis |
[
"IFRD1",
"PPIE",
"EIF5",
"LTBR",
"MAP7D1",
"VAPB",
"DDX27",
"LRRFIP1",
"UPF3B",
"NSRP1",
"DGCR6L",
"DCTD",
"MED10",
"CAB39",
"RAP1GDS1",
"C1orf35",
"ZC3H8",
"RP9",
"NME6",
"KCMF1",
"POLR3C",
"DBNDD2",
"CNPY2",
"CEP95"
] | null |
[
"MCUR1",
"DIMT1",
"THOC5",
"NSMCE4A",
"BAG2",
"FARSB",
"UCHL5",
"EXOSC8",
"EEF1E1",
"EMG1",
"ESD",
"SPATC1L",
"ARL5A",
"FXN",
"NUDT5",
"DNAJC21",
"SMARCC1",
"PSMG1"
] | null |
[
"HCCS",
"AGPS",
"FAM136A",
"MTREX",
"PITHD1",
"KIF2A",
"REXO2",
"EXOSC5",
"PCNP",
"MTIF2",
"MRPL28",
"METTL2A",
"CDC34",
"ARMC1",
"UBXN8",
"PLEKHJ1",
"PDCD5",
"POLR2I",
"TMEM147",
"ZPR1",
"MAGOHB",
"CHPT1",
"UNC50",
"C1orf109",
"CENPK",
"UBA2",
"EIF3G",
"VPS4A",... | null |
README.md exists but content is empty.
- Downloads last month
- 4